Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tmed11Q9D2R4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed11Q9D2R4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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