Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF354BQ96LW1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF354BQ96LW1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms