Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms