Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r72Q8K3N7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Vmn1r72Q8K3N7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Vmn1r72Q8K3N7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Vmn1r72Q8K3N7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Vmn1r72Q8K3N7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Vmn1r72Q8K3N7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Vmn1r72Q8K3N7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r72Q8K3N7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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