Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms