Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vash1Q8C1W1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vash1Q8C1W1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vash1Q8C1W1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vash1Q8C1W1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vash1Q8C1W1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vash1Q8C1W1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vash1Q8C1W1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vash1Q8C1W1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vash1Q8C1W1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vash1Q8C1W1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vash1Q8C1W1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vash1Q8C1W1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms