Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcl3Q8BVF2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms