Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms