Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms