Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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