Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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