Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms