Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F1Q03052 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms