Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms