Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33aP97950 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33aP97950 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33aP97950 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33aP97950 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33aP97950 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab33aP97950 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab33aP97950 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab33aP97950 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab33aP97950 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms