Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndst2P52850 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndst2P52850 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndst2P52850 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndst2P52850 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndst2P52850 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndst2P52850 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndst2P52850 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndst2P52850 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndst2P52850 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndst2P52850 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndst2P52850 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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