Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms