Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp1O89090 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp1O89090 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp1O89090 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp1O89090 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp1O89090 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp1O89090 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp1O89090 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp1O89090 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp1O89090 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp1O89090 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp1O89090 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp1O89090 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp1O89090 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp1O89090 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp1O89090 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp1O89090 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp1O89090 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms