Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn6O35646 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms