Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Gm379J3QQ19 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Gm379J3QQ19 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
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Gm379J3QQ19 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gm379J3QQ19 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gm379J3QQ19 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gm379J3QQ19 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm379J3QQ19 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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