Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3250E9Q1M3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms