Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms