Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms