Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms