Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc1Q9QZF2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gpc1Q9QZF2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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