Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 C4orf22-201ENST00000358105 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC013452.2-201ENST00000557910 743 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 RPL26L1-201ENST00000265100 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC011290.1-201ENST00000439751 414 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 RNASEH2B-AS1-201ENST00000454605 1007 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 RPL26L1-206ENST00000521476 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 Z98949.1-208ENST00000597614 816 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AL132996.1-201ENST00000569865 1431 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms