Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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