Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmem54Q9D7S1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmem54Q9D7S1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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