Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7H3

RtcA, RNA 3'-terminal phosphate cyclase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcAQ9D7H3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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