Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA7Q9BWT1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA7Q9BWT1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms