Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms