Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA6Q92908 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA6Q92908 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA6Q92908 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA6Q92908 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA6Q92908 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA6Q92908 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA6Q92908 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA6Q92908 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms