Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trps1Q925H1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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