Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGDNQ8NEJ9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGDNQ8NEJ9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms