Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp1Q8BJQ2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp1Q8BJQ2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp1Q8BJQ2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp1Q8BJQ2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp1Q8BJQ2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp1Q8BJQ2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp1Q8BJQ2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp1Q8BJQ2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp1Q8BJQ2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp1Q8BJQ2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp1Q8BJQ2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp1Q8BJQ2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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