Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTE2Q6XPS3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms