Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms