Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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TRAF3Q13114 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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