Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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