Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms