Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01679 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01679 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01679 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01679 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01679 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01679 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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P01679 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01679 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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P01679 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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P01679 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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P01679 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01679 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01679 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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P01679 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01679 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01679 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01679 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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P01679 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01679 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01679 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01679 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01679 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01679 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01679 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01679 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01679 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01679 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01679 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01679 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01679 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01679 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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