Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms