Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn4O35054 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn4O35054 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn4O35054 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn4O35054 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn4O35054 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn4O35054 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn4O35054 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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