Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBDO15205 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBDO15205 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBDO15205 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms