Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms