Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms