Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D1F3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms