Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.072e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-212ENST00000554539 748 ntTSL 58.16□□□□□ -1.18e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 LPP-205ENST00000426274 386 ntTSL 57.38□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 LPP-210ENST00000457242 479 ntTSL 26.59□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 SMARCB1-208ENST00000634926 269 ntTSL 1 (best)2.01□□□□□ -2.092e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 SMARCB1-209ENST00000635578 242 ntTSL 1 (best)0.65□□□□□ -2.312e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 33.7
TBRG4Q969Z0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 33.7
TBRG4Q969Z0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.847e-8■■■■■ 33.7
TBRG4Q969Z0 KANSL1-223ENST00000639150 1815 ntTSL 516.3■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 33.7
TBRG4Q969Z0 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 33.7
TBRG4Q969Z0 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 33.7
TBRG4Q969Z0 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 33.7
TBRG4Q969Z0 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.67e-8■■■■■ 33.7
TBRG4Q969Z0 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 33.7
TBRG4Q969Z0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 DHX34-202ENST00000460681 1838 ntTSL 518.9■□□□□ 0.625e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 DHX34-204ENST00000486327 2897 ntTSL 518.47■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.755e-11■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 523.76■■□□□ 1.393e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 223.68■■□□□ 1.385e-11■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 EXOC3L4-205ENST00000560102 563 ntTSL 321.12■□□□□ 0.975e-11■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 EXOC3L4-202ENST00000559116 460 ntTSL 516.76■□□□□ 0.275e-11■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 312.44□□□□□ -0.423e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 TBCK-204ENST00000394708 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.723e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 TBCK-202ENST00000361687 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-209ENST00000547704 760 ntTSL 59.39□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 59.39□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.974e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 TBCK-206ENST00000467183 3566 ntTSL 1 (best)8.36□□□□□ -1.074e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.253e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.54e-6■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.663e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-208ENST00000547529 892 ntTSL 53.66□□□□□ -1.823e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-225ENST00000552147 1009 ntTSL 53.51□□□□□ -1.853e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 52.76□□□□□ -1.973e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 52.53□□□□□ -23e-7■■■■■ 33.6
TBRG4Q969Z0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 33.5
TBRG4Q969Z0 SHCBP1L-204ENST00000488956 2540 ntTSL 219.58■□□□□ 0.735e-8■■■■■ 33.5
TBRG4Q969Z0 SHCBP1L-203ENST00000483655 2023 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.555e-8■■■■■ 33.5
TBRG4Q969Z0 DRD4-202ENST00000528733 361 ntTSL 314.84□□□□□ -0.035e-8■■■■■ 33.5
TBRG4Q969Z0 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC7.96□□□□□ -1.145e-8■■■■■ 33.5
TBRG4Q969Z0 SHCBP1L-202ENST00000467208 692 ntTSL 57.81□□□□□ -1.165e-8■■■■■ 33.5
TBRG4Q969Z0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 33.4
TBRG4Q969Z0 SEPT9-215ENST00000586521 601 ntTSL 417.37■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-203ENST00000430811 860 ntTSL 224.64■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-213ENST00000526842 535 ntTSL 517.22■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 314.1□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-207ENST00000464190 604 ntTSL 213.57□□□□□ -0.246e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-220ENST00000531532 554 ntTSL 411.64□□□□□ -0.556e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 511.55□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-213ENST00000527470 532 ntTSL 411.55□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-217ENST00000529333 778 ntTSL 411.55□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 511.5□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 211.49□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 311.48□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-215ENST00000528084 535 ntTSL 411.44□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-221ENST00000534372 544 ntTSL 510.32□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 29.97□□□□□ -0.816e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.826e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.33□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.096e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.166e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-219ENST00000531291 572 ntTSL 57.61□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-216ENST00000528968 587 ntTSL 56.87□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-217ENST00000529361 555 ntTSL 55.33□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 PTPN4-203ENST00000430976 4154 ntTSL 55.14□□□□□ -1.593e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 34.06□□□□□ -1.766e-8■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-202ENST00000399614 594 ntTSL 43.82□□□□□ -1.83e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 MSI2-210ENST00000579505 577 ntTSL 317.81■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 MYO18A-218ENST00000546105 1442 ntTSL 219.83■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 MYO18A-205ENST00000529578 2667 ntTSL 212.73□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 33.3
TBRG4Q969Z0 MYO18A-211ENST00000531438 565 ntTSL 49.6□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 33.3
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