Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM2Q8N271 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms