Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

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Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl47Q8K2Y7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mrpl47Q8K2Y7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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